RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM223	A0PJW6	202 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ERICH4	A6NGS2	130 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	BCKDK	O14874	412 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NFAT5	O94916	1531 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	STAG3L3	P0CL85	134 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ITGB4	P16144	1822 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NPY1R	P25929	384 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PMEL	P40967	661 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TNFSF9	P41273	254 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	MAGEA1	P43355	309 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	IRF8	Q02556	426 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM205	Q6UW68	189 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	LGI3	Q8N145	548 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	OR8U1	Q8NH10	309 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PEX13	Q92968	403 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NRBF2	Q96F24	287 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CLN6	Q9NWW5	311 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM120B	A0PK00	339 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284		H0YIV9	168 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	GABRP	O00591	440 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NME4	O00746	187 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PLPP1	O14494	284 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	SEMA3D	O95025	777 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	HPRT1	P00492	218 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	APCS	P02743	223 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CD37	P11049	281 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	RALB	P11234	206 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PEX19	P40855	299 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NBL1	P41271	181 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	RAD51	Q06609	339 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR2DS1	Q14954	304 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NCF4	Q15080	339 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	SAXO2	Q658L1	398 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR86	Q86TI4	376 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	HORMAD1	Q86X24	394 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF561	Q8N587	486 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR26	Q8NDV2	337 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PTX4	Q96A99	478 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	RNF145	Q96MT1	663 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	MED4	Q9NPJ6	270 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PSME2	Q9UL46	239 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	PALLD	Q8WX93	1383 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM150B	A6NC51	233 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	AKR7A2	O43488	359 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CTSL	P07711	333 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CISD3	P0C7P0	127 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF806	P0C7X5	589 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	RAB4A	P20338	218 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TALDO1	P37837	337 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	SERPINB8	P50452	374 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	SYNJ2BP	P57105	145 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	TAS2R46	P59540	309 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	AVPI1	Q5T686	147 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPRK-215	ENST00000498284	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		2.53	□□□□□ -2

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