RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC2A1	P11166	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CFHR2	P36980	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SELENOV	P59797	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FGF12	P61328	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CSNK2B	P67870	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CRMP1	Q14194	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PYURF	Q96I23	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ATF6B	Q99941	703 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		M0R135	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CCDC22	O60826	627 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GADD45G	O95257	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LHB	P01229	141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GAST	P01350	101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MELTF	P08582	738 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ANPEP	P15144	967 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SPI1	P17947	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TUBG1	P23258	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CA6	P23280	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OMG	P23515	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ACKR3	P25106	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC6A6	P31641	620 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PITPNB	P48739	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RGS6	P49758	472 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MS4A2	Q01362	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MOG	Q16653	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LNX2	Q8N448	690 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		Q8N7P7	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MED20	Q9H944	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBE3C-208	ENST00000497368	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBE3C-208	ENST00000497368	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBE3C-208	ENST00000497368		F5H5K5	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBE3C-208	ENST00000497368	LGALS8	O00214	317 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBE3C-208	ENST00000497368	PHYH	O14832	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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