RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 MAP6Q96JE9 813 aa11.52□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 GAFA1Q96PS6 74 aa11.52□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM220BPB1ANY3 271 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 C3orf84H3BNL1 204 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SIGLEC5O15389 551 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 XRCC2O43543 280 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 PEX14O75381 377 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 NPPAP01160 153 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ALDOBP05062 364 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 PF4V1P10720 104 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 DGUOKQ16854 277 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TCF19Q9Y242 345 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SACSQ9NZJ4 4579 aa11.51□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 H0YAE9 185 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 RENP00797 406 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 PF4P02776 101 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 NOS3P29474 1203 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 MXRA7P84157 204 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SPIBQ01892 262 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 COQ5Q5HYK3 327 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 VTCN1Q7Z7D3 282 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.5□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 A6NDX4 124 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 CDIPTO14735 213 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ARPC3O15145 178 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 GLCEO94923 617 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 NDUFB7P17568 137 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 PAX6P26367 422 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OMPP47874 163 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SMARCD3Q6STE5 483 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 LNX2Q8N448 690 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OR2T12Q8NG77 320 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 NMNAT3Q96T66 252 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 LRP12Q9Y561 859 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 U3KQK5 164 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.49□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1W2PRQ8 180 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1W2PRX2 142 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 HLA-DQA2P01906 255 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 POU1F1P28069 291 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 DGCR6Q14129 220 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 IFI44LQ53G44 452 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 MKXQ8IYA7 352 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 DPF1Q92782 380 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 RAB21Q9UL25 225 aa11.48□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 UNC119BA6NIH7 251 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF823P16415 610 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 LGALS4P56470 323 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM3AP98173 230 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 IL5RAQ01344 420 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SNCBQ16143 134 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 KLHL22Q53GT1 634 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 KCNJ15Q99712 375 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 COPS4Q9BT78 406 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 MUC13Q9H3R2 512 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TENM2Q9NT68 2774 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1W2PPH5 198 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OR6C68A6NDL8 312 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM210A6NLX4 147 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 F2RL2O00254 374 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms