RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2V2	Q96R30	315 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ABCA1	O95477	2261 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290		H0YL77	283 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	COL8A2	P25067	703 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	MAP2K3	P46734	347 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ETV1	P50549	477 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC35A2	P78381	396 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ST3GAL4	Q11206	333 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC58	Q4VC31	144 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	DOK3	Q7L591	496 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	C10orf35	Q96D05	121 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ITPKC	Q96DU7	683 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290		F5H5P2	479 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	HLA-DPB1	P04440	258 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	MYL12A	P19105	171 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CA6	P23280	308 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	MVK	Q03426	396 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	MZT1	Q08AG7	82 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	OR8G1	Q15617	311 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	REG4	Q9BYZ8	158 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	DUSP21	Q9H596	190 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	GCM1	Q9NP62	436 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290		J3QLW9	94 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CDK1	P06493	297 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	HTR1A	P08908	422 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF19	P17023	458 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	PSMB10	P40306	273 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	MED21	Q13503	144 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	HFE	Q30201	348 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290		H7C1Q1	480 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	P2RY10	O00398	339 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CD99	P14209	185 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF12	P17014	697 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CRHBP	P24387	322 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	IRF3	Q14653	427 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CDK5R1	Q15078	307 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1B0GVI7	797 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM210	A6NLX4	147 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290		E9PI62	339 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-208	ENST00000487290	CFHR2	P36980	270 aa		13.97	□□□□□ -0.17

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