RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 UBL3O95164 117 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 PSKH1P11801 424 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 FPR3P25089 353 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 HTR2AP28223 471 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 HTR1FP30939 366 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 DEFA6Q01524 100 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ZP4Q12836 540 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAM2Q15035 370 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SNAPC1Q16533 368 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SHISA2Q6UWI4 295 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 C5orf46Q6UWT4 87 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 OAFQ86UD1 273 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF584Q8IVC4 421 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5H6Q8NGV6 325 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 FGFBP3Q8TAT2 258 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX33Q8WV41 574 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 GHITMQ9H3K2 345 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF726A6NNF4 738 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 LEUTXA8MZ59 168 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 J3QLI3 93 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 GABRPO00591 440 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 CTDSPLO15194 276 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC22A5O76082 557 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 TPPPO94811 219 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV2-5P01817 119 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SERPINA5P05154 406 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 CD1AP06126 327 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 CCL2P13500 99 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 C4BPBP20851 252 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 TALDO1P37837 337 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 RAD52P43351 418 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 INPP1P49441 399 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 TAS2R43P59537 309 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SELENOVP59797 346 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXL1Q12952 345 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 CLLU1Q5K131 121 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 GID4Q8IVV7 300 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SKA3Q8IX90 412 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC17Q8N6Y2 441 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGDIGQ99819 225 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 MED9Q9NWA0 146 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 MCUBQ9NWR8 336 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR160Q9UJ42 338 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 NPTNQ9Y639 398 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 CACNG2Q9Y698 323 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 CHP2O43745 196 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SOX14O95416 240 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 HKR1P10072 659 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ANXA3P12429 323 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 FPR2P25090 351 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 STOMP27105 288 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 CSNK1A1P48729 337 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ERVS71-1P61550 626 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 MXD1Q05195 221 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 PUDPQ08623 228 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ST3GAL3Q11203 375 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 IL18Q14116 193 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 PCGF3Q3KNV8 242 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 TEX261Q6UWH6 196 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC51BQ86UW2 128 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 COMTD1Q86VU5 262 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 RFT1Q96AA3 541 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 DUX5Q96PT3 197 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 RHCGQ9UBD6 479 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 NLKQ9UBE8 527 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 OPN4Q9UHM6 478 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 U3KQ87 197 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRN3E7EW58 273 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 SURF4O15260 269 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-207ENST00000484547 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms