RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 RRM2P31350 389 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SYKP43405 635 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SULT1E1P49888 294 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TRAM2Q15035 370 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CBLN2Q8IUK8 224 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 MARVELD1Q9BSK0 173 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ABCA3Q99758 1704 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 MYO5BQ9ULV0 1848 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 RNF13O43567 381 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 AQP8O94778 261 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 NDUFA8P51970 172 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 RAB10P61026 200 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ART3Q13508 389 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PNOCQ13519 176 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PGGHGQ32M88 737 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 LYPD6BQ8NI32 183 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 GHSRQ92847 366 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 NRBF2Q96F24 287 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 BEX1Q9HBH7 125 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ZFYVE9O95405 1425 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CCNB3Q8WWL7 1395 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 XKRY2A2RUG3 117 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PDZK1P1A8MUH7 402 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TNFRSF11BO00300 401 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 MANBAO00462 879 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 NTF3P20783 257 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 PRAMEF20Q5VT98 475 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 NUP58Q9BVL2 599 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 MTCH1Q9NZJ7 389 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
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SGCE-210ENST00000472326 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa2.91□□□□□ -1.94
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SGCE-210ENST00000472326 TECPR2O15040 1411 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 OVOS2Q6IE36 1432 aa2.91□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CCDC18Q5T9S5 1454 aa2.9□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 CCDC141Q6ZP82 1450 aa2.9□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 KIF15Q9NS87 1388 aa2.9□□□□□ -1.94
SGCE-210ENST00000472326 KCPQ6ZWJ8 1503 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 GCC2Q8IWJ2 1684 aa2.9□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 LSM1O15116 133 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 CHMP2AO43633 222 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 MED27Q6P2C8 311 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 STK40Q8N2I9 435 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 GPR82Q96P67 336 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 CCDC144AA2RUR9 1427 aa2.9□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 SZT2Q5T011 3432 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 MBD5Q9P267 1494 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 COL6A3P12111 3177 aa2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 LMTK2Q8IWU2 1503 aa2.89□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa2.89□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 C10orf71Q711Q0 1435 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TPD52L3Q96J77 140 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 C18orf15Q96N68 181 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 NUDT9Q9BW91 350 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TMEM38AQ9H6F2 299 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 LINC00574Q9H8X3 128 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PXDNLA1KZ92 1463 aa2.89□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
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