RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 D6RAR5 112 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 GABRR1P24046 479 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 OTX2P32243 289 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 UBE2V2Q15819 145 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 A0A0J9YW62 118 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 C9J4A7 227 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ZIC3O60481 467 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 PGAP1Q75T13 922 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 BATF2Q8N1L9 274 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 FBXW5Q969U6 566 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ULBP2Q9BZM5 246 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 PROK2Q9HC23 129 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 B8ZZF3 427 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ZNF205O95201 554 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 LIFP15018 202 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 HIST3H3Q16695 136 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 SNAI3Q3KNW1 292 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 OPN5Q6U736 354 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 NAXDQ8IW45 347 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 MITD1Q8WV92 249 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 MARVELD3Q96A59 401 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 OR10A2Q9H208 303 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 GPR173Q9NS66 373 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 RNF222A6NCQ9 220 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 THAP6Q8TBB0 222 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 SLC2A8Q9NY64 477 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 PMS2P1A4D2B8 440 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ANGPTL7O43827 346 aa15.93■□□□□ 0.14
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HPS3-202ENST00000460120 MGMTP16455 207 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 AGTR1P30556 359 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 FGL1Q08830 312 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 S100A13Q99584 98 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 NELFAQ9H3P2 528 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 TRAPPC6AO75865 159 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 KNG1P01042 644 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 CD8AP01732 235 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 PTGFRP43088 359 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 OR3A2P47893 321 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ZDHHC22Q8N966 263 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 DCUN1D4Q92564 292 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 FBXO17Q96EF6 278 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 CHRM2P08172 466 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ZP3P21754 424 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 BRICD5Q6PL45 260 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 GJC3Q8NFK1 279 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 PXT1Q8NFP0 134 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 TERB2Q8NHR7 220 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 C5orf66Q9H5L9 145 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 EHFQ9NZC4 300 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 PISDQ9UG56 409 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 M0R135 149 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 DHHO43323 396 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 IGHV3-9P01782 118 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 APOC3P02656 99 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 CD63P08962 238 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 GLRA1P23415 457 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HPS3-202ENST00000460120 CTAG1AP78358 180 aa15.91■□□□□ 0.14
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