RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa23.15■■□□□ 1.3
FAAP20-210ENST00000440825 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 OOEPA6NGQ2 149 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 SLC22A31A6NKX4 558 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF850A8MQ14 1090 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 CPT2P23786 658 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ACKR3P25106 362 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 CSNK2BP67870 215 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 POU4F2Q12837 409 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 SNCBQ16143 134 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 NXNL2Q5VZ03 156 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 KCTD8Q6ZWB6 473 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 WDR86Q86TI4 376 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 SLC35F2Q8IXU6 374 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 OR1M1Q8NGA1 313 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC29Q8WV35 223 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ASB17Q8WXJ9 295 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PIGCQ92535 297 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 MICU1Q9BPX6 476 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 STAB1Q9NY15 2570 aa23.14■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 A0A0A6YYJ9 748 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PRR32B1ATL7 298 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ADAM20O43506 726 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 GYPAP02724 150 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 RIDAP52758 137 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PRDX4Q13162 271 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 AADACL4Q5VUY2 407 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 GCSAMQ8N6F7 178 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 OR8B4Q96RC9 309 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 SUCNR1Q9BXA5 334 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 FAM206AQ9NX38 181 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 EGR1P18146 543 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 FPR2P25090 351 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 GMFBP60983 142 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 CXCR4P61073 352 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 IL5RAQ01344 420 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 GID4Q8IVV7 300 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF679Q8IYX0 411 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 RAB40AQ8WXH6 277 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 RTL8AQ9BWD3 113 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ERVK-18Q9QC07 812 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PHYHO14832 338 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 FSHBP01225 129 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 DEGS2Q6QHC5 323 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 OR51G2Q8NGK0 314 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ITPKCQ96DU7 683 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 TBX5Q99593 518 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PKP2Q99959 881 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 APOL4Q9BPW4 351 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PBOV1Q9GZY1 135 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRL4Q9HBW9 690 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM36Q9NQ86 728 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 CTSZQ9UBR2 303 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF391Q9UJN7 358 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 NUP50Q9UKX7 468 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 MPC1Q9Y5U8 109 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 EFNB1P98172 346 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PAX2Q02962 417 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ROM1Q03395 351 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PAX8Q06710 450 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 FAM90A1Q86YD7 464 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 C11orf53Q8IXP5 236 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 OR51E1Q8TCB6 317 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R14AQ96A00 147 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 OSBPL10Q9BXB5 764 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 CDIPTO14735 213 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF254O75437 659 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 APOL3O95236 402 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 PSMB10P40306 273 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 HILS1P60008 231 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ACTR3P61158 418 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 WDR82Q6UXN9 313 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF841Q6ZN19 808 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 GALNT4Q8N4A0 578 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 RNF170Q96K19 258 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 GABARAPL3Q9BY60 117 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-210ENST00000440825 ACOD1A6NK06 481 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms