RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 LHX9Q9NQ69 397 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 DAPP1Q9UN19 280 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 AUP1Q9Y679 476 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 CCSO14618 274 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SPINT2O43291 252 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PTHLHP12272 177 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 TAF9Q16594 264 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 TRIM61Q5EBN2 209 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 MED25Q71SY5 747 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 KMT5CQ86Y97 462 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 MITD1Q8WV92 249 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZBP1Q9H171 429 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 POFUT1Q9H488 388 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 OPN4Q9UHM6 478 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 A0A1B0GV50 99 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 C9orf170A2RU37 121 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 E5RGE8 158 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 H0YIG0 161 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PHOX2AO14813 284 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 HPNP05981 417 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PTGER4P35408 488 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PPICP45877 212 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SELENOPP49908 381 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 DHODHQ02127 395 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 LIPHQ8WWY8 451 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 GPR137Q96N19 417 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 NSG2Q9Y328 171 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ANK1P16157 1881 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 C7orf66A4D0T2 115 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 MPTX1A8MV57 137 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 CDC42EP2O14613 210 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 NTN1O95631 604 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 WNT11O96014 354 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 HPXP02790 462 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PSMB6P28072 239 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 LIMS1P48059 325 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ARG2P78540 354 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZNF85Q03923 595 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PRR22Q8IZ63 422 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 OR5D18Q8NGL1 313 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 OR4A16Q8NH70 328 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 F5P12259 2224 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 A0A087WZY1 265 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 A0A1B0GX78 115 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 OR5H14A6NHG9 310 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 A6NNC1 897 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 M0QZK8 103 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 IGHA1P01876 353 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 FOLR1P15328 257 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 BIDP55957 195 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 H3F3AP84243 136 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 PMPCAQ10713 525 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 IKZF1Q13422 519 aa5.74□□□□□ -1.49
BDNF-211ENST00000439476 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.74□□□□□ -1.49
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