RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 C17orf50Q8WW18 174 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 SGCDQ92629 289 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 DNTTIP1Q9H147 329 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 TLNRD1Q9H1K6 362 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 MEGF9Q9H1U4 602 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 HAO2Q9NYQ3 351 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa12.16□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 TVP23AA6NH52 213 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 CDIPTO14735 213 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC22A2O15244 555 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 PSKH1P11801 424 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 PYCR1P32322 319 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 LY6EQ16553 131 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 AANATQ16613 207 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 HCP5Q6MZN7 132 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 PGBD2Q6P3X8 592 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC16A9Q7RTY1 509 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 DTX3Q8N9I9 347 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 CYB561A3Q8NBI2 242 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 OR51G2Q8NGK0 314 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNRF4Q8WWF5 429 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 SGK3Q96BR1 496 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 ITPKCQ96DU7 683 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 MED30Q96HR3 178 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 AJUBAQ96IF1 538 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 RAB18Q9NP72 206 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 CENPMQ9NSP4 180 aa12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
ACTBP11-201ENST00000436287 SMIM11AP58511 58 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 BLMHQ13867 455 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT72Q14CN4 511 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 TAF13Q15543 124 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 DGUOKQ16854 277 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 LYPD4Q6UWN0 246 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 OR2T4Q8NH00 348 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 RORBQ92753 470 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 SLAMF6Q96DU3 332 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 CLPTM1LQ96KA5 538 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR13Q9H1Z4 485 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 SNTG1Q9NSN8 517 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF391Q9UJN7 358 aa12.14□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 TENM3Q9P273 2699 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 MEGF11A6BM72 1044 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 NDUFAB1O14561 156 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 VSIG10L2P0DP72 767 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 GSSP48637 474 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 CAV3P56539 151 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 VAX1Q5SQQ9 334 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 CGB2Q6NT52 195 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 LYG1Q8N1E2 194 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM86B1Q8N7N1 296 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 OR5D13Q8NGL4 314 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 ANGPTL6Q8NI99 470 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 REEP6Q96HR9 211 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 GAFA1Q96PS6 74 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 MMP28Q9H239 520 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 CD300AQ9UGN4 299 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa12.13□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 A0A1W2PQ09 198 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 NKX6-3A6NJ46 265 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF878C9JN71 531 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 SIGLEC5O15389 551 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 TBX1O43435 398 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 GADD45GO95257 159 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 SPARCP09486 303 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 IFNGR2P38484 337 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC15A1P46059 708 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 GSK3AP49840 483 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 ENTPD1P49961 510 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 MXRA7P84157 204 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 IL5RAQ01344 420 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 TEX30Q5JUR7 227 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 GLYATQ6IB77 296 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 OR51L1Q8NGJ5 315 aa12.12□□□□□ -0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 PIFOQ8TCI5 191 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms