RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TPPPO94811 219 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFA7O95182 113 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 IGF2P01344 180 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-DQB1P01920 261 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OPN1SWP03999 348 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 BCHEP06276 602 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SFTPBP07988 381 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR12D1P0DN82 309 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF17P17021 662 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV1-2P23083 117 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TNFSF8P32971 234 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GRK5P34947 590 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MAP3K8P41279 467 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR3A2P47893 321 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 WNT4P56705 351 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SCN1BQ07699 218 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ASAH1Q13510 395 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GINS1Q14691 196 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SYT14P1Q58G82 188 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CASC10Q5T4H9 136 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HACD4Q5VWC8 232 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CDC73Q6P1J9 531 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GDPD3Q7L5L3 318 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR2L13Q8N349 312 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR2M3Q8NG83 312 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ABHD3Q8WU67 409 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GLMPQ8WWB7 406 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GIMAP5Q96F15 307 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CMTM3Q96MX0 182 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR5M11Q96RB7 305 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 BBS4Q96RK4 519 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TBX15Q96SF7 602 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 STACQ99469 402 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CENPOQ9BU64 300 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR51E2Q9H255 320 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PLK3Q9H4B4 646 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CA10Q9NS85 328 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 AASSQ9UDR5 926 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 BAIAP2Q9UQB8 552 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 U3KQK5 164 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WUU8 490 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HMX3A6NHT5 357 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SAP18O00422 153 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PRKYO43930 277 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GMFGO60234 142 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SNAPC5O75971 98 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SCGB1D2O95969 90 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CRYAAP02489 173 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GBAP04062 536 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CLPSP04118 112 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-DPB1P04440 258 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MYL12AP19105 171 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 DRD5P21918 477 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ACHEP22303 614 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-DMAP28067 261 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 HTR1FP30939 366 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GABRA5P31644 462 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SOAT1P35610 550 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 DDOSTP39656 456 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PPICP45877 212 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OMPP47874 163 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RFX3P48380 749 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP10-3P60369 221 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LMO4P61968 165 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PSPHP78330 225 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SELENBP1Q13228 472 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MED22Q15528 200 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 EFNB3Q15768 340 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SYPL1Q16563 259 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 C18orf63Q68DL7 685 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms