RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CCNOP22674 350 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 ARR3P36575 388 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 GSK3AP49840 483 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM3AP98173 230 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 COLCA1Q6ZS62 124 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 OR2W3Q7Z3T1 314 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM104Q8NE00 496 aa18.74■□□□□ 0.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 OR6F1Q8NGZ6 308 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 SEH1LQ96EE3 360 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 RGCCQ9H4X1 137 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 GFRA3O60609 400 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 STOMP27105 288 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM53Q6P2H8 277 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 BTN2A1Q7KYR7 527 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 NICN1Q9BSH3 213 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 GTF3C1Q12789 2109 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PP11 408 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 C5orf49A4QMS7 147 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 A8MV72 311 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 SULT1C2O00338 296 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 XRCC2O43543 280 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 FCER2P06734 321 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 VEGFCP49767 419 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 GUSBP1Q15486 140 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TBRG1Q3YBR2 411 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF260Q3ZCT1 412 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB12Q6IQ22 244 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TFAP2EQ6VUC0 442 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 C1QL2Q7Z5L3 287 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 LPAR5Q9H1C0 372 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 BANF2Q9H503 90 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A0A6YYD4 124 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM235A6NFC5 223 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 CDC14BO60729 498 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 MPIG6BO95866 241 aa18.72■□□□□ 0.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF584Q8IVC4 421 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf106Q8NAJ2 232 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNG3Q8TAE7 436 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 AQP3Q92482 292 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 SPSB4Q96A44 273 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 ST6GAL2Q96JF0 529 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 MCUBQ9NWR8 336 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 LPLP06858 475 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 UBBP0CG47 229 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 OR8B8Q15620 311 aa18.71■□□□□ 0.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 SCPEP1Q9HB40 452 aa18.71■□□□□ 0.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP5-204ENST00000412806 DHFRP00374 187 aa18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP5-204ENST00000412806 NAT2P11245 290 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 GTF2F2P13984 249 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 ATAD3CQ5T2N8 411 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM42Q69YG0 159 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZTK2 550 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 RTN4RL2Q86UN3 420 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 OR4C16Q8NGL9 310 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 POM121L2Q96KW2 1035 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 C20orf85Q9H1P6 137 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A0A6YYJ9 748 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 ALDH3B1P43353 468 aa18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP5-204ENST00000412806 CDNFQ49AH0 187 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC22A6Q4U2R8 563 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 CLVS2Q5SYC1 327 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 OR4D10Q8NGI6 311 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 OR10R2Q8NGX6 335 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 WNT2BQ93097 391 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM59Q9BXS4 323 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF221Q9UK13 617 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 FLVCR2Q9UPI3 526 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 LHX6Q9UPM6 363 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 WASF3Q9UPY6 502 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 SCGNO76038 276 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 IGHV1-2P23083 117 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 PLP2Q04941 152 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 GSG1Q2KHT4 349 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00303Q3SY05 128 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 SPSB1Q96BD6 273 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP5-204ENST00000412806 DCHS1Q96JQ0 3298 aa18.69■□□□□ 0.58
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