RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPSB4Q96A44 273 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PGAM5Q96HS1 289 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CIB1Q99828 191 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 YIPF3Q9GZM5 350 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR10A2Q9H208 303 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MMP27Q9H306 513 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRD7Q9NPI1 651 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAV40A0A0B4J280 105 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC182A6NF36 153 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM178BH3BS89 294 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 M0R129 80 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 GMDSO60547 372 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 IRF2P14316 349 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAG2P55895 527 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAX2Q02962 417 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 GFOD2Q3B7J2 385 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRICD5Q6PL45 260 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT77Q7Z794 578 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR11L1Q8NGX0 322 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM163Q8TC26 289 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 REEP6Q96HR9 211 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TEAD3Q99594 435 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 NIPAL2Q9H841 368 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SRRM5B3KS81 715 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TIMM23O14925 209 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 EPHA2P29317 976 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDOSTP39656 456 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 GATA4P43694 442 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNB2P62879 340 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 DEFB112Q30KQ8 113 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRSS45Q7RTY3 260 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLBQ86Z14 1044 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 GID4Q8IVV7 300 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERGIC1Q969X5 290 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PKP2Q99959 881 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CITED1Q99966 193 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 GABARAPL3Q9BY60 117 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRDM13Q9H4Q3 707 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGCCQ9H4X1 137 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALOX5APP20292 161 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MZT1Q08AG7 82 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAB21L1Q13394 359 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPERTQ8NA61 448 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SGK3Q96BR1 496 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 FN3KRPQ9HA64 309 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNFRSF19Q9NS68 423 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MIOXQ9UGB7 285 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRP12Q9Y561 859 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ORC6Q9Y5N6 252 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 NDUFA7O95182 113 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 BPIFB3P59826 476 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM3AP98173 230 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNCBQ16143 134 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q8TCH9 128 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASB17Q8WXJ9 295 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBE2FQ969M7 185 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 MROQ9BYG7 248 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM165Q9HC07 324 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOX4Q9NPH5 578 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 UFSP2Q9NUQ7 469 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLPSL1A2RUU4 121 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 H3BNX3 289 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM20BO75063 409 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-204ENST00000373166 HCCSP53701 268 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms