RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 TAAR6Q96RI8 345 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 C20orf85Q9H1P6 137 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 OR10A4Q9H209 315 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 CLCF1Q9UBD9 225 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 A0A0A6YYD4 124 aa15.54■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 GSG1Q2KHT4 349 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZTK2 550 aa15.53■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.53■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 GP6Q9HCN6 339 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 C7orf66A4D0T2 115 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 C5orf49A4QMS7 147 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-201ENST00000331789 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.53■□□□□ 0.08
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ACTB-201ENST00000331789 ARR3P36575 388 aa15.52■□□□□ 0.07
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ACTB-201ENST00000331789 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.52■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 FJX1Q86VR8 437 aa15.52■□□□□ 0.07
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ACTB-201ENST00000331789 XRCC2O43543 280 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 UBBP0CG47 229 aa15.51■□□□□ 0.07
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ACTB-201ENST00000331789 FAUP35544 74 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 RAG2P55895 527 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 ACTBP60709 375 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 ACTG1P63261 375 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 CBX3Q13185 183 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 CYYR1Q96J86 154 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 OR51J1Q9H342 316 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 NEK6Q9HC98 313 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 K7EM74 188 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 NRASP01111 189 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-201ENST00000331789 COX5BP10606 129 aa15.51■□□□□ 0.07
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