RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 PYY3Q5JQD4 70 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 SGK3Q96BR1 496 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 C5orf34Q96MH7 638 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 BCO1Q9HAY6 547 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 GSKIPQ9P0R6 139 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 SOCS1O15524 211 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 CDC14BO60729 498 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 RAD51DO75771 328 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 H2BFMP0C1H6 154 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 PGCP20142 388 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 GLRA1P23415 457 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 FCARP24071 287 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ITGA3P26006 1051 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 GNALP38405 381 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 OR2B8PP59922 312 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 RPS23P62266 143 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 DEFA6Q01524 100 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ZP4Q12836 540 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 GPM6BQ13491 265 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 SQSTM1Q13501 440 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 COX15Q7KZN9 410 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 FAM219AQ8IW50 185 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 TMEM104Q8NE00 496 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 PFDN5Q99471 154 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 KCNJ16Q9NPI9 418 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 DECR2Q9NUI1 292 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 PRR13Q9NZ81 148 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 TCFL5Q9UL49 500 aa9.97□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 MYO7AQ13402 2215 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ALG1L2C9J202 215 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 MASP2O00187 686 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 HCRTR2O43614 444 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 CA11O75493 328 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 APODP05090 189 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 CTSBP07858 339 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 GP1BBP13224 206 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 DAOP14920 347 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 PI3P19957 117 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 AMY2BP19961 511 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 P2RY1P47900 373 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 CLINT1Q14677 625 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 GPR157Q5UAW9 335 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 OOSP2Q86WS3 158 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 OR5AS1Q8N127 324 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 FNDC9Q8TBE3 224 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 MUCL1Q96DR8 90 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 DEFB118Q96PH6 123 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GINS3-202ENST00000328514 A0A087WWC5 75 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 A0A1W2PPE2 198 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 E5RGE8 158 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 ARG1P05089 322 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 SFTPBP07988 381 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 PTGER4P35408 488 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 ALDH3B1P43353 468 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 OR3A2P47893 321 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 SLC35A1P78382 337 aa9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GINS3-202ENST00000328514 PPA1Q15181 289 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms