RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326298.8

CCNC-201, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCNC, Length 2,212 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-201ENST00000326298 ITPKCQ96DU7 683 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 A0A1W2PRD5 423 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 A0A1W2PRF3 423 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 A0A1W2PRM7 423 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 H3BN98 237 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 CST1P01037 141 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 IGHV4-59P01825 116 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 GSTT1P30711 240 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ST8SIA4Q92187 359 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 INTS14Q96SY0 518 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SP140LQ9H930 580 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 C1RLQ9NZP8 487 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SRRM5B3KS81 715 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 AKR7A2O43488 359 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 RHBDL1O75783 438 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 GLCEO94923 617 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 RAP2AP10114 183 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 KLRD1Q13241 179 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 IKZF1Q13422 519 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 TIGD6Q17RP2 521 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SPATS1Q496A3 300 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 CPOQ8IVL8 374 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 Q8N7P7 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 GIPC3Q8TF64 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 C17orf50Q8WW18 174 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ASB9Q96DX5 294 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 THTPAQ9BU02 230 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 XRCC2O43543 280 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ZNF3P17036 446 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SLC2A5P22732 501 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 HSD11B1P28845 292 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 EPHA2P29317 976 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 MTNR1AP48039 350 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ERVFRD-1P60508 538 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 GPR157Q5UAW9 335 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 OR8S1Q8NH09 359 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 OTOSQ8NHW6 89 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 THEM6Q8WUY1 208 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SLC22A4Q9H015 551 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 NDE1Q9NXR1 346 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 COPS3Q9UNS2 423 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 MEGF11A6BM72 1044 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 IGHV1-69P01742 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 DCTDP32321 178 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 GRK5P34947 590 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 CDK5Q00535 292 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 PRDX4Q13162 271 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 TAF9Q16594 264 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 DGUOKQ16854 277 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 STUMQ69YW2 141 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 PKP2Q99959 881 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 LRP12Q9Y561 859 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 CCDC182A6NF36 153 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 FAM107AO95990 144 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 LYNP07948 512 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 H2BFMP0C1H6 154 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 ALOX5APP20292 161 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 CALB2P22676 271 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 SLC15A1P46059 708 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 TGM4P49221 684 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNC-201ENST00000326298 CEP78Q5JTW2 689 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.8 ms