RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308127.8

SSH3-201, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SSH3, Length 2,871 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3-201ENST00000308127 CD79AP11912 226 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 BRICD5Q6PL45 260 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 GKN2Q86XP6 184 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PIGTQ969N2 578 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 OR5B2Q96R09 309 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 A6NIZ1 184 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 F5H5K5 113 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 F8VVB4 439 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 F8VWA3 439 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 MBTPS2O43462 519 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 DAOP14920 347 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 SLC6A9P48067 706 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 RAP1BP61224 184 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 RAP1AP62834 184 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 BATF2Q8N1L9 274 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 SFT2D2O95562 160 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 SFTA3P0C7M3 94 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 CD38P28907 300 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 DCAF7P61962 342 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 HSD11B2P80365 405 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 STOML3Q8TAV4 291 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PTX4Q96A99 478 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 ZNF878C9JN71 531 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 STMND1H3BQB6 276 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 GABRR1P24046 479 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 LAP3P28838 519 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 CX3CR1P49238 355 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 P2RY4P51582 365 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 SP6Q3SY56 376 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 UQCC3Q6UW78 93 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 LRRC18Q8N456 261 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 TMEM234Q8WY98 164 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 FGF21Q9NSA1 209 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 LIPT2A6NK58 231 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 CCR5P51681 352 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 ACY1Q03154 408 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 DYRK2Q92630 601 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 ISOC2Q96AB3 205 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 CDC6Q99741 560 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 NMES1Q9C002 83 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 GPR27Q9NS67 375 aa14.63□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 OR8U9P0C7N5 309 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 FAHP16930 419 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 FHITP49789 147 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PCK2Q16822 640 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 OR8U1Q8NH10 309 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 FAM221AA4D161 298 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 LILRA5A6NI73 299 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 TIAF1O95411 115 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PPT1P50897 306 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 CHAF1BQ13112 559 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 MMP26Q9NRE1 261 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.62□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 TO15178 435 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 QDPRP09417 244 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 PTGER4P35408 488 aa14.61□□□□□ -0.07
SSH3-201ENST00000308127 RFC3P40938 356 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms