RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 CST4P01036 141 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CD1AP06126 327 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEB1P43366 347 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 RDH10Q8IZV5 341 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF676Q8N7Q3 588 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 C10orf35Q96D05 121 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PERPQ96FX8 193 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR5M11Q96RB7 305 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ABCB9Q9NP78 766 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 HHLA2Q9UM44 414 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PLPP2O43688 288 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 NCR1O76036 304 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 HLA-DPB1P04440 258 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CA6P23280 308 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TNFSF4P23510 183 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CHN2P52757 468 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MED22Q15528 200 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TESK1Q15569 626 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM42Q69YG0 159 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SVOPQ8N4V2 548 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SPERTQ8NA61 448 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR10AD1Q8NGE0 317 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PGLYRP3Q96LB9 341 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ISYNA1Q9NPH2 558 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ACOT13Q9NPJ3 140 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 IL19Q9UHD0 177 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 H0YL77 283 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TNFAIP8O95379 198 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 HPXP02790 462 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 FAHP16930 419 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 GNALP38405 381 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CD200P41217 278 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MAP2K4P45985 399 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CDH15P55291 814 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CCL8P80075 99 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR8G1Q15617 311 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF773Q6PK81 442 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF367Q7RTV3 350 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SPARTQ8N0X7 666 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR51A4Q8NGJ6 313 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ITPKCQ96DU7 683 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 EGLN1Q9GZT9 426 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 DECR2Q9NUI1 292 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ANXA2P2A6NMY6 339 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 LY6HO94772 140 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TNFRSF1AP19438 455 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CELP19835 753 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PCMT1P22061 227 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 GATA4P43694 442 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SLC3A1Q07837 685 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PRDX4Q13162 271 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MAB21L1Q13394 359 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 GPR50Q13585 617 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 YIF1BQ5BJH7 314 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SHEQ5VZ18 495 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ITLN1Q8WWA0 313 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PIGCQ92535 297 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 GHSRQ92847 366 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR2V2Q96R30 315 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CHST5Q9GZS9 411 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.5 ms