RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287916.8

CLDN12-201, Transcript of claudin 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN12, Length 3,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12-201ENST00000287916 CST7O76096 145 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ABHD16AO95870 558 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 MLF1P58340 268 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 MFAP5Q13361 173 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 TMEM123Q8N131 208 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RNF128Q8TEB7 428 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 SPTA1P02549 2419 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF726A6NNF4 738 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RAB27BO00194 218 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 FOXS1O43638 330 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 GUSBP08236 651 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 PNLIPP16233 465 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZBTB25P24278 435 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 TMEM33P57088 247 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 SLC26A5P58743 744 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RAB2AP61019 212 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 UNC119Q13432 240 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 Q6ZS52 159 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 NECAP1Q8NC96 275 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 NT5CQ8TCD5 201 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 MRI1Q9BV20 369 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 IL23AQ9NPF7 189 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RAB22AQ9UL26 194 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 QDPRP09417 244 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 PTAFRP25105 342 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 EGR3Q06889 387 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 MCHR2Q969V1 340 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 NELFAQ9H3P2 528 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 MEGF11A6BM72 1044 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 WRBO00258 174 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 DUSP1P28562 367 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 GPR3P46089 330 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 EXD3Q8N9H8 876 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 OR6S1Q8NH40 331 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 FAM117AQ9C073 453 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 MEMO1Q9Y316 297 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 KLK2P20151 261 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 BMP5P22003 454 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 CRABP1P29762 137 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 OR1D5P58170 312 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 NHLH2Q02577 135 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 GGTLC2Q14390 218 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ACER2Q5QJU3 275 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 RARRES2Q99969 163 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 GPR173Q9NS66 373 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 PADI1Q9ULC6 663 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 R4GMQ9 66 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 C3orf80F5H4A9 247 aa7.11□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF749O43361 778 aa7.11□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 SOX15O60248 233 aa7.11□□□□□ -1.27
CLDN12-201ENST00000287916 OR2C1O95371 312 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms