RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 K7ESF4 209 aa14.51□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 IGHMP01871 453 aa14.51□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 PMP2P02689 132 aa14.51□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 OR10K2Q6IF99 312 aa14.51□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.51□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 RNF170Q96K19 258 aa14.51□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 MS4A18H0YCH9 400 aa14.5□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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CTCF-201ENST00000264010 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 OR10A2Q9H208 303 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 DLL4Q9NR61 685 aa14.48□□□□□ -0.09
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CTCF-201ENST00000264010 SELENOPP49908 381 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 MMP16P51512 607 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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CTCF-201ENST00000264010 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 OR52W1Q6IF63 320 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCF-201ENST00000264010 SGCZQ96LD1 299 aa14.47□□□□□ -0.09
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