RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 SLC38A6Q8IZM9 456 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 FUCA1P04066 466 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ATF1P18846 271 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 XKR7Q5GH72 579 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 DHHO43323 396 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 RNF224P0DH78 156 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 DCTDP32321 178 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 GP2P55259 537 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 OXA1LQ15070 435 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CLDN23Q96B33 292 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ASB1Q9Y576 335 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CBR3O75828 277 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 KRASP01116 189 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CCR5P51681 352 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 FAM3AP98173 230 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM77I1YAP6 450 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 GABRB1P18505 474 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 DPTQ07507 201 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF766Q5HY98 468 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 A0A1W2PPC4 97 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 FBP1P09467 338 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ARRB2P32121 409 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 BMI1P35226 326 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 HLA-BQ31612 363 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 LYG2Q86SG7 212 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 FUT6P51993 359 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CCL17Q92583 94 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 RPEQ96AT9 228 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 PLEKHA2Q9HB19 425 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 IFITM5A6NNB3 132 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 C1QBP02746 253 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 GSG1Q2KHT4 349 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TAAR9Q96RI9 348 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 GPANK1O95872 356 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CD37P11049 281 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 SPEM2Q0P670 501 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 C20orf196Q8IYI0 205 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 J3QR89 54 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 RAB1AP62820 205 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 FAM26EQ8N5C1 309 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 SMIM19Q96E16 107 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CHRDL1Q9BU40 450 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 BMPR1BO00238 502 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CEACAM6P40199 344 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 PGFP49763 221 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 MEOX1P50221 254 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 OR2T2Q6IF00 324 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM88Q6PEY1 159 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 FOXB1Q99853 325 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 PNLIPRP2P54317 469 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 PAX5Q02548 391 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CLEC9AQ6UXN8 241 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 POMT1Q9Y6A1 747 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV3-13P01766 116 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV3-7P01780 117 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 BMP5P22003 454 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 BSGP35613 385 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 OR3A4PP47883 348 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 LIMK1P53667 647 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ISL1P61371 349 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 FAM162BQ5T6X4 162 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ACSM4P0C7M7 580 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 NOVP48745 357 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 EXTL1Q92935 676 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 DOK5Q9P104 306 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ZAR1LA6NP61 321 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 FCGR3BO75015 233 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV3-43DP0DP04 118 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 TRAPPC4Q9Y296 219 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 PLPP6Q8IY26 295 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 CADM3Q8N126 398 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 LYG1Q8N1E2 194 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
ZBED3-201ENST00000255198 ASAH1Q13510 395 aa18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms