RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A1Q86YD7 464 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 OR51G2Q8NGK0 314 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RASD2Q96D21 266 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DMRTB1Q96MA1 342 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF570Q96NI8 536 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 WACQ9BTA9 647 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GPR61Q9BZJ8 451 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD19PQ9H560 264 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM36Q9NQ86 728 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KAAG1Q9UBP8 84 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SIGLEC7Q9Y286 467 aa13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GW55 424 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SGCEO43556 437 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 AHCYL1O43865 530 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINA1P01009 418 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DUX4L2P0CJ85 424 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DUX4L3P0CJ86 424 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DUX4L4P0CJ87 422 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DUX4L5P0CJ88 424 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DUX4L6P0CJ89 424 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DUX4L7P0CJ90 424 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 VHLP40337 213 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZBED5Q49AG3 693 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CMTM4Q8IZR5 234 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SDR9C7Q8NEX9 313 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 Q8NFD4 153 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PYDC1Q8WXC3 89 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DCTN5Q9BTE1 182 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 CHID1Q9BWS9 393 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM100Q9NV29 134 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 GRHPRQ9UBQ7 328 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 DUX4Q9UBX2 424 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ENPP4Q9Y6X5 453 aa13.28□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 OR6C6A6NF89 314 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 ACOT8O14734 319 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 GSTA4O15217 222 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 CHRM2P08172 466 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 SDHAP31040 664 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 BMXP51813 675 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 MS4A2Q01362 244 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 AQP6Q13520 282 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00482Q8N8I6 264 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 PIFOQ8TCI5 191 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 ASCL2Q99929 193 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 SYT4Q9H2B2 425 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 NRIP3Q9NQ35 241 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 ACTR3BQ9P1U1 418 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM5Q9Y2B1 443 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 ALMS1Q8TCU4 4167 aa13.27□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PRQ8 180 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 AQP12BA6NM10 295 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 XKRYO14609 159 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 PTP4A3O75365 173 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 NCK1P16333 377 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 PAX6P26367 422 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 OMPP47874 163 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 DGCR6Q14129 220 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 PTCHD4Q6ZW05 846 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP9P1Q75LS8 142 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 AQP12AQ8IXF9 295 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 DHRS1Q96LJ7 313 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 OR5M11Q96RB7 305 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 FUZQ9BT04 418 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 CDCA4Q9BXL8 241 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 PALMDQ9NP74 551 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFAF4Q9P032 175 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 ATPIF1Q9UII2 106 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa13.26□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFB2O95178 105 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 H1F0P07305 194 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 DBHP09172 617 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 LSM6P62312 80 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 SEC23BQ15437 767 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 NCR3LG1Q68D85 454 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 GPR139Q6DWJ6 353 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 LCN8Q6JVE9 175 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 HCP5Q6MZN7 132 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 OR5L1Q8NGL2 311 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf46Q8TAG6 207 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 C7orf34Q96L11 122 aa13.25□□□□□ -0.29
SPCS1-201ENST00000233025 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms