RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 USP26Q9BXU7 913 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-215ENST00000628018 IL25Q9H293 177 aa30.16■■■□□ 2.42
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CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-215ENST00000628018 RUFY2Q8WXA3 655 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRKQ9NRH2 765 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-215ENST00000628018 ZAP70P43403 619 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 BCAMP50895 628 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 TMC4Q7Z404 712 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 ANTXR1Q9H6X2 564 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ4P48050 445 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 PI16Q6UXB8 463 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 MASTLQ96GX5 879 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC51AQ86UW1 340 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 XDHP47989 1333 aa30.11■■■□□ 2.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 HMG20BQ9P0W2 317 aa30.11■■■□□ 2.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.1■■■□□ 2.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 GYG1P46976 350 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 RASGRF1Q13972 1273 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 CAVIN4Q5BKX8 364 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD50Q92878 1312 aa30.09■■■□□ 2.41
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPSM2P81274 684 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO33Q7Z6M2 555 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 C2CD5Q86YS7 1000 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SP8Q8IXZ3 490 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA5Q8NB90 893 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 ANO2Q9NQ90 1003 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0D9SFI3 127 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YIN7 160 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PODXL2Q9NZ53 605 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf71Q711Q0 1435 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 KLRK1P26718 216 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 STYK1Q6J9G0 422 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.06■■■□□ 2.4
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CAPNS1-215ENST00000628018 CHGBP05060 677 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP2B4P23634 1241 aa30.04■■■□□ 2.4
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CAPNS1-215ENST00000628018 TXNRD3Q86VQ6 643 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF2CQ99661 725 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 DOCK2Q92608 1830 aa30.02■■■□□ 2.4
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CAPNS1-215ENST00000628018 MTFR1LQ9H019 292 aa30.01■■■□□ 2.4
CAPNS1-215ENST00000628018 HELLSQ9NRZ9 838 aa30.01■■■□□ 2.4
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CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA3EO15041 775 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB7AO95365 584 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNA5P30532 468 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA1SQ13698 1873 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 UFL1O94874 794 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 DDRGK1Q96HY6 314 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.392e-6■■□□□ 12.4
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.99■■■□□ 2.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CNKSR1Q969H4 720 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 POLLQ9UGP5 575 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 PTH1RQ03431 593 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MCCP23508 829 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 IDH1O75874 414 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
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