RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.69■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 MX1P20591 662 aa25.69■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 ATP2B4P23634 1241 aa25.69■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 MPNDQ8N594 471 aa25.69■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.69■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 UFL1O94874 794 aa25.68■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 SLC5A1P13866 664 aa25.68■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.68■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 GGA1Q9UJY5 639 aa25.68■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.67■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.67■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 PHKA1P46020 1223 aa25.66■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.66■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 GYG1P46976 350 aa25.65■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 BCAMP50895 628 aa25.65■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC93Q567U6 631 aa25.65■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.65■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 BCS1LQ9Y276 419 aa25.65■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 KCNJ4P48050 445 aa25.64■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 SCARF1Q14162 830 aa25.64■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC102BQ68D86 513 aa25.64■■□□□ 1.7
CSAG3-202ENST00000617158 AOX1Q06278 1338 aa25.63■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.63■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 MED23Q9ULK4 1368 aa25.63■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 C6orf229H3BNL8 230 aa25.62■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 ATP5JP18859 108 aa25.62■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 COL4A5P29400 1685 aa25.61■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 CHD4Q14839 1912 aa25.61■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 NFKBIEO00221 500 aa25.61■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 TTC22Q5TAA0 569 aa25.61■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.61■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 PSMD1Q99460 953 aa25.6■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 PRELPP51888 382 aa25.59■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.59■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 GORABQ5T7V8 394 aa25.59■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 SOGA3Q5TF21 947 aa25.59■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.59■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 RIMBP2O15034 1052 aa25.58■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 MCAMP43121 646 aa25.58■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 PI16Q6UXB8 463 aa25.58■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.58■■□□□ 1.69
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB22O15209 634 aa25.57■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.57■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.57■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 GPATCH3Q96I76 525 aa25.57■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 RASGRF1Q13972 1273 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 WASHC4Q2M389 1173 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 HAUS7Q99871 368 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.56■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 AOC3Q16853 763 aa25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 CD209Q9NNX6 404 aa25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 SNRKQ9NRH2 765 aa25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 ERC2O15083 957 aa25.54■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 IL1R1P14778 569 aa25.54■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.54■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 EYA3Q99504 573 aa25.54■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 SCN9AQ15858 1988 aa25.54■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.54■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 ZAP70P43403 619 aa25.53■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 RASSF7Q02833 373 aa25.53■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 DOK7Q18PE1 504 aa25.53■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.53■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.53■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.53■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.53■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 SDSP20132 328 aa25.52■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 COA1Q9GZY4 146 aa25.52■■□□□ 1.68
CSAG3-202ENST00000617158 SBF1O95248 1867 aa25.51■■□□□ 1.67
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA5Q8NB90 893 aa25.51■■□□□ 1.67
CSAG3-202ENST00000617158 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.51■■□□□ 1.67
CSAG3-202ENST00000617158 PPIP5K2O43314 1243 aa25.5■■□□□ 1.67
CSAG3-202ENST00000617158 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CSAG3-202ENST00000617158 AK9Q5TCS8 1911 aa25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms