RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616920.1

CYCSP41-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 41, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP41, Length 296 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP41-201ENST00000616920 CSRNP1Q96S65 589 aa8.71□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.71□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 TREHO43280 583 aa8.7□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 RAC1P63000 192 aa8.7□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.7□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 DCAF5Q96JK2 942 aa8.7□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.7□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 A0A0A0MRY4 1105 aa8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 FAM177BA6PVY3 158 aa8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 PTPRAP18433 802 aa8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 CDC27P30260 824 aa8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 MAPK8P45983 427 aa8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 BAG6P46379 1132 aa8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 DSC3Q14574 896 aa8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 NPHS2Q9NP85 383 aa8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.68□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 NFKBIEO00221 500 aa8.68□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.68□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.68□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.68□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.68□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 A0A1W2PP55 124 aa8.67□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.67□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 NXPE3Q969Y0 559 aa8.67□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 PPME1Q9Y570 386 aa8.67□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 KRBA1A5PL33 1030 aa8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 LINC01387J3KSC0 135 aa8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 GRIK4Q16099 956 aa8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 CCDC27Q2M243 656 aa8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 EHD4Q9H223 541 aa8.66□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.65□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 METTL12A8MUP2 240 aa8.65□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 EPHA1P21709 976 aa8.65□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 MUC3BQ9H195 1237 aa8.65□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.65□□□□□ -1.02
CYCSP41-201ENST00000616920 APBA3O96018 575 aa8.64□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 ILDR2Q71H61 639 aa8.64□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.64□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 ADAM19Q9H013 955 aa8.64□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 ELNP15502 786 aa8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 CABP4P57796 275 aa8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 PI16Q6UXB8 463 aa8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 FBXO11Q86XK2 927 aa8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 SETDB2Q96T68 719 aa8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.63□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 ATP2B2Q01814 1243 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 SETDB1Q15047 1291 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 CCNJLQ8IV13 435 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 BSNDQ8WZ55 320 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 TCF12Q99081 682 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 SOX13Q9UN79 622 aa8.62□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 H3BRJ5 948 aa8.61□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.61□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 A0A096LPE4 126 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 A0A1W2PPZ6 126 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 FSCN2O14926 492 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 CHRNA4P43681 627 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 GRIA4P48058 902 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 CD163Q86VB7 1156 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 NACC1Q96RE7 527 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 USP21Q9UK80 565 aa8.6□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 SELPP16109 830 aa8.59□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 IKBKEQ14164 716 aa8.59□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 GRM2Q14416 872 aa8.59□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.59□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.59□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.59□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.59□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.59□□□□□ -1.03
CYCSP41-201ENST00000616920 DLL1O00548 723 aa8.58□□□□□ -1.04
CYCSP41-201ENST00000616920 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CYCSP41-201ENST00000616920 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.58□□□□□ -1.04
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