RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L8P0C7I0 530 aa26.57■■□□□ 1.84
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TRAPPC3-208ENST00000616074 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.57■■□□□ 1.84
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.57■■□□□ 1.84
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TRAPPC3-208ENST00000616074 DACT2Q5SW24 774 aa26.52■■□□□ 1.84
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TRAPPC3-208ENST00000616074 COA1Q9GZY4 146 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.5■■□□□ 1.83
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC10A3P09131 477 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3-208ENST00000616074 BEND3Q5T5X7 828 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3-208ENST00000616074 OGFOD1Q8N543 542 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.45■■□□□ 1.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.41■■□□□ 1.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CD209Q9NNX6 404 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRPA1O75762 1119 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.4■■□□□ 1.82
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.34■■□□□ 1.81
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TRAPPC3-208ENST00000616074 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL1R1P14778 569 aa26.33■■□□□ 1.81
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3-208ENST00000616074 ALDH1L1O75891 902 aa26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3-208ENST00000616074 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3-208ENST00000616074 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLIN1O60240 522 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3-208ENST00000616074 RGS19P49795 217 aa26.31■■□□□ 1.8
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