RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	MMP14	P50281	582 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXO4	P98177	505 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	CST9	Q5W186	159 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	COL4A1	P02462	1669 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLIN1	O60240	522 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCARF1	Q14162	830 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	HUNK	P57058	714 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF609	O15014	1411 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	TAF5L	O75529	589 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	EGFR	P00533	1210 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP2K2	P36507	400 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTF2I	P78347	998 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXN1	O15353	648 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	NF2	P35240	595 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	GML	Q99445	158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYH3	P11055	1940 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	UTY	O14607	1347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	CA12	O43570	354 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	NOG	Q13253	232 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYO1B	O43795	1136 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	KLRK1	P26718	216 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	FKBP1B	P68106	108 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	LBX1	P52954	281 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	AOC2	O75106	756 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	SASH1	O94885	1247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL1R1	P14778	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNAP23	O00161	211 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	WNT10B	O00744	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-222	ENST00000614197	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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