RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SYT9Q86SS6 491 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 WWC1Q8IX03 1113 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ELOA3Q8NG57 546 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 DCCP43146 1447 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 FAM229AH3BQW9 127 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 TBCELQ5QJ74 424 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 LAMC2Q13753 1193 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ZNF358Q9NW07 568 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 PTCH1Q13635 1447 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SOX11P35716 441 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 GTF2IP78347 998 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 POTEAQ6S8J7 498 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 BRINP3Q76B58 766 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 UCN2Q96RP3 112 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SLC30A3Q99726 388 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 EML1O00423 815 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SKIP12755 728 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 EPHA4P54764 986 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 EML3Q32P44 896 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 GLMNQ92990 594 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 TPSG1Q9NRR2 321 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SETD5Q9C0A6 1442 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 JCADQ9P266 1359 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 M0R082 166 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 BACH1O14867 736 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 TECPR2O15040 1411 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 PIK3C2GO75747 1445 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ALAS2P22557 587 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 NOS2P35228 1153 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 PSME1Q06323 249 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 TEAD4Q15561 434 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 NOD1Q9Y239 953 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SIN3BO75182 1162 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ALBP02768 609 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 NCOA4Q13772 614 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 TNS4Q8IZW8 715 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 EP400Q96L91 3159 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 ZMYND15Q9H091 742 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 MYOM2P54296 1465 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-212ENST00000597259 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ATF3P18847 181 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 TNFRSF25Q93038 417 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ADGRB1O14514 1584 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 USP32Q8NFA0 1604 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 DYRK3O43781 588 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 APBA3O96018 575 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 GRIK4Q16099 956 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ORAI2Q96SN7 254 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 PXDNQ92626 1479 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms