RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 CASQ1P31415 396 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 MCM6Q14566 821 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 HOMER1Q86YM7 354 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 FAM107BQ9H098 131 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 USP44Q9H0E7 712 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 LAMB2P55268 1798 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 LAMA4Q16363 1823 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 NPHP1O15259 732 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 BANK1Q8NDB2 785 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 NBPF4Q96M43 638 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 PSMA5P28066 241 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ICE2Q659A1 982 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 LINS1Q8NG48 757 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 MAP3K11Q16584 847 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.96□□□□□ -1.29
SEH1L-210ENST00000592582 CAVIN2O95810 425 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MFSD10Q14728 455 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 USP48Q86UV5 1035 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 KIF2CQ99661 725 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.96□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 FIBPO43427 364 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MICALL2Q8IY33 904 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 EVI5LQ96CN4 794 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM94Q12767 1356 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SPEF2Q9C093 1822 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PTGS1P23219 599 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TMX3Q96JJ7 454 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CYP2C19P33261 490 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD1Q15327 319 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 BEND3Q5T5X7 828 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 LGR6Q9HBX8 967 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.95□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TULP2O00295 520 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TDO2P48775 406 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ZSCAN26Q16670 478 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TNMDQ9H2S6 317 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SNRKQ9NRH2 765 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GRM8O00222 908 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 BRD1O95696 1058 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 AACSQ86V21 672 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PPM1EQ8WY54 764 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 RNF40O75150 1001 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PDCP20941 246 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GTF3C6Q969F1 213 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TOMM22Q9NS69 142 aa6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms