RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 G2E3Q7L622 706 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-211ENST00000590874 MXD3Q9BW11 206 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-211ENST00000590874 STK31Q9BXU1 1019 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT4P50991 539 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC184Q52MB2 194 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP1BP68106 108 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DACT2Q5SW24 774 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MOB2Q70IA6 237 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SPEF2Q9C093 1822 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C1W4 665 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF9Q3BBW0 867 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa32.9■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNRD3Q86VQ6 643 aa32.9■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC27Q2M243 656 aa32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 WWC1Q8IX03 1113 aa32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW7Q969H0 707 aa32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A2P04920 1241 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 COA1Q9GZY4 146 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH3P11055 1940 aa32.88■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 KLRK1P26718 216 aa32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 STRIP1Q5VSL9 837 aa32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GCKRQ14397 625 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 LEMD3Q9Y2U8 911 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO3BQ8WXR4 1341 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2Q2LH0YL09 131 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT10BO00744 389 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA6P23229 1130 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 OGFOD1Q8N543 542 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G12BQ9BX93 195 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP7P55210 303 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF804BA4D1E1 1349 aa32.83■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SASH1O94885 1247 aa32.83■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FLIIQ13045 1269 aa32.83■■■□□ 2.85
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP11Q9UKA4 1901 aa32.81■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 IL16Q14005 1332 aa32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC34A2O95436 690 aa32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CSF1RP07333 972 aa32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 MPHOSPH8Q99549 860 aa32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD2Q9GZV1 360 aa32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL5Q6EMB2 1281 aa32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAAF4Q8WXU2 420 aa32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0825Q8IV33 1275 aa32.78■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.78■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCIQ9NVI1 1328 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX10P56693 466 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNDQ07001 517 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 LINS1Q8NG48 757 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2IP78347 998 aa32.76■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 NF2P35240 595 aa32.75■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAP23O00161 211 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D8O95759 1140 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ4P48050 445 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP14P50281 582 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC9Q9UKV0 1011 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 IRS2Q9Y4H2 1338 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CD209Q9NNX6 404 aa32.73■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa32.72■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKG1Q13976 671 aa32.72■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 VAMP4O75379 141 aa32.71■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TM4SF4P48230 202 aa32.71■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF5LO75529 589 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CERS5Q8N5B7 392 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXO4P98177 505 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC9Q7Z3E5 817 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 HPS5Q9UPZ3 1129 aa32.68■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 F6X3S4 739 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD1Q9UP38 647 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 LDLRAD1Q5T700 205 aa32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 DLGAP5Q15398 846 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 BEND3Q5T5X7 828 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MRS2Q9HD23 443 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP3Q9Y3E7 222 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR25O00155 361 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SREBF2Q12772 1141 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR63Q8IWG1 891 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB129Q9H1M3 183 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GUL6 1792 aa32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms