RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	EGFR	P00533	1210 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	CES1	P23141	567 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	RASSF7	Q02833	373 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	NLRP13	Q86W25	1043 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	EPX	P11678	715 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ARID5A	Q03989	594 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC30A3	Q99726	388 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	EHD4	Q9H223	541 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO24	O75426	580 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ACPP	P15309	386 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	FCGRT	P55899	365 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	PAK2	Q13177	524 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	SPATA32	Q96LK8	384 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GML	Q99445	158 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	MDFI	Q99750	246 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PP55	124 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	MMP20	O60882	483 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	TRPA1	O75762	1119 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	GDF11	O95390	407 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	ADH6	P28332	368 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	GSTT1	P30711	240 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	CCIN	Q13939	588 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	FGR	P09769	529 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	GPRASP2	Q96D09	838 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	RARA	P10276	462 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	GJA8	P48165	433 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	DGKG	P49619	791 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	PIF1	Q9H611	641 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	EDN3	P14138	238 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	NFKB1	P19838	968 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	OR13H1	Q8NG92	308 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	BTBD6	Q96KE9	485 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	ITGB2	P05107	769 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	CHSY3	Q70JA7	882 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	HHIP	Q96QV1	700 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	TCF12	Q99081	682 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	SPON2	Q9BUD6	331 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms