RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GIPC1-210ENST00000589497 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 SNAP23O00161 211 aa23.61■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.61■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.61■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 MEIS3Q99687 375 aa23.61■■□□□ 1.37
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GIPC1-210ENST00000589497 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.6■■□□□ 1.37
GIPC1-210ENST00000589497 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.6■■□□□ 1.37
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GIPC1-210ENST00000589497 LRRC24Q50LG9 513 aa23.59■■□□□ 1.37
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GIPC1-210ENST00000589497 TNNQ9UQP3 1299 aa23.59■■□□□ 1.37
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GIPC1-210ENST00000589497 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
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GIPC1-210ENST00000589497 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.55■■□□□ 1.36
GIPC1-210ENST00000589497 SIL1Q9H173 461 aa23.55■■□□□ 1.36
GIPC1-210ENST00000589497 MS4A1P11836 297 aa23.54■■□□□ 1.36
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GIPC1-210ENST00000589497 DACT2Q5SW24 774 aa23.54■■□□□ 1.36
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GIPC1-210ENST00000589497 PASKQ96RG2 1323 aa23.54■■□□□ 1.36
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.53■■□□□ 1.36
GIPC1-210ENST00000589497 SRGAP3O43295 1099 aa23.53■■□□□ 1.36
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GIPC1-210ENST00000589497 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.53■■□□□ 1.36
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GIPC1-210ENST00000589497 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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GIPC1-210ENST00000589497 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.47■■□□□ 1.35
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GIPC1-210ENST00000589497 F8W031 263 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GIPC1-210ENST00000589497 RLBP1P12271 317 aa23.46■■□□□ 1.35
GIPC1-210ENST00000589497 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GIPC1-210ENST00000589497 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GIPC1-210ENST00000589497 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GIPC1-210ENST00000589497 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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