RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 GYS1P13807 737 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP10Q86W26 655 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM89AQ96GI7 184 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 SUCLG2Q96I99 432 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP10DQ9P241 1426 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 SSFA2P28290 1259 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 DDR1Q08345 913 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 GCKRQ14397 625 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 NFIXQ14938 502 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 SKAP1Q86WV1 359 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 LINS1Q8NG48 757 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 COL4A1P02462 1669 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-208ENST00000589162 CASZ1Q86V15 1759 aa7.59□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC12Q96J65 1359 aa7.59□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 GRM8O00222 908 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ALDH1L1O75891 902 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHDP01880 384 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 MS4A1P11836 297 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CASP7P55210 303 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ERFEQ4G0M1 354 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC51AQ86UW1 340 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC125Q86Z20 511 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 KAZALD1Q96I82 304 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL11AQ9H165 835 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 H7C1W4 665 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB7AO95365 584 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 NTSR2O95665 410 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMB2P55268 1798 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 AVPP01185 164 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPINB2P05120 415 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP10P09238 476 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXO4P98177 505 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF1P21675 1872 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SPEF2Q9C093 1822 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 APBB1O00213 710 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 GNAI2P04899 355 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 TM4SF1P30408 202 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP85Q6P2H3 762 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SETDB2Q96T68 719 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 UTYO14607 1347 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 AXIN1O15169 862 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 NPHP1O15259 732 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ST8SIA5O15466 376 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 GNAI3P08754 354 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM161AQ3B820 660 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 PARP10Q53GL7 1025 aa7.54□□□□□ -1.2
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