RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.79■■□□□ 1.56
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TRAF4-216ENST00000586813 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAF4-216ENST00000586813 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAF4-216ENST00000586813 GCKRQ14397 625 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC102AQ96A19 550 aa24.77■■□□□ 1.56
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TRAF4-216ENST00000586813 MRS2Q9HD23 443 aa24.76■■□□□ 1.55
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TRAF4-216ENST00000586813 FAM161AQ3B820 660 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAF4-216ENST00000586813 DACT2Q5SW24 774 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAF4-216ENST00000586813 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAF4-216ENST00000586813 SLC10A3P09131 477 aa24.73■■□□□ 1.55
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TRAF4-216ENST00000586813 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAF4-216ENST00000586813 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.72■■□□□ 1.55
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TRAF4-216ENST00000586813 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-216ENST00000586813 MXD3Q9BW11 206 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-216ENST00000586813 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-216ENST00000586813 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.71■■□□□ 1.55
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TRAF4-216ENST00000586813 WDR63Q8IWG1 891 aa24.71■■□□□ 1.55
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TRAF4-216ENST00000586813 OGFOD1Q8N543 542 aa24.7■■□□□ 1.54
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TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.65■■□□□ 1.54
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TRAF4-216ENST00000586813 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.63■■□□□ 1.53
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TRAF4-216ENST00000586813 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.61■■□□□ 1.53
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TRAF4-216ENST00000586813 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.55■■□□□ 1.52
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TRAF4-216ENST00000586813 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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TRAF4-216ENST00000586813 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAF4-216ENST00000586813 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.53■■□□□ 1.52
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