RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583704.1

TTC19-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 2

Gene TTC19, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-210ENST00000583704 USP17L3A6NCW0 530 aa28.48■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 USP17L4A6NCW7 530 aa28.48■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.48■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 GMLQ99445 158 aa28.48■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 SULF1Q8IWU6 871 aa28.47■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 TSKSQ9UJT2 592 aa28.47■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 CSF1RP07333 972 aa28.45■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 USP17L8P0C7I0 530 aa28.45■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 SCARF1Q14162 830 aa28.45■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.45■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 F6X3S4 739 aa28.44■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.44■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.44■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.44■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.43■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 FBXW7Q969H0 707 aa28.43■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 KLRK1P26718 216 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 NOGQ13253 232 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 CDCA5Q96FF9 252 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 ZIC5Q96T25 663 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 MXD3Q9BW11 206 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 COA1Q9GZY4 146 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 DACT2Q5SW24 774 aa28.41■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 BEND3Q5T5X7 828 aa28.41■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 RGMBQ6NW40 437 aa28.41■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.41■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 A0A1B0GUL6 1792 aa28.41■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.39■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 CA12O43570 354 aa28.39■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 CHRNDQ07001 517 aa28.39■■■□□ 2.14
TTC19-210ENST00000583704 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 FOXO4P98177 505 aa28.38■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.38■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 KCNJ4P48050 445 aa28.37■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.37■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 MYO3BQ8WXR4 1341 aa28.37■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.37■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 ABHD8Q96I13 439 aa28.36■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.35■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 OGFOD1Q8N543 542 aa28.35■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.35■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.34■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 SNAP23O00161 211 aa28.34■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.34■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 CCDC102AQ96A19 550 aa28.34■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 ZNF521Q96K83 1311 aa28.34■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 GRM8O00222 908 aa28.33■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 TAF5LO75529 589 aa28.33■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.33■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.33■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TTC19-210ENST00000583704 WNT10BO00744 389 aa28.32■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 GTF2IP78347 998 aa28.32■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 SLC10A3P09131 477 aa28.31■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.31■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.31■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 SASH1O94885 1247 aa28.3■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.3■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.3■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 CD209Q9NNX6 404 aa28.3■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 CCER2I3L3R5 266 aa28.29■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.28■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 FKBP1BP68106 108 aa28.28■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.28■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.28■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 MOB2Q70IA6 237 aa28.28■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.28■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 ALDH1L1O75891 902 aa28.27■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.27■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.27■■■□□ 2.12
TTC19-210ENST00000583704 MMP14P50281 582 aa28.26■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.25■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 PLIN1O60240 522 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 CERS5Q8N5B7 392 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 SAGE1Q9NXZ1 904 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 E9PSI1 815 aa28.23■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 SUCLG2Q96I99 432 aa28.23■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 CSRNP1Q96S65 589 aa28.23■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.23■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.22■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 IL1R1P14778 569 aa28.22■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 RNF186Q9NXI6 227 aa28.22■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.22■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 TRPA1O75762 1119 aa28.21■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TTC19-210ENST00000583704 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms