RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.41■■■□□ 2.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 SCARF1Q14162 830 aa28.4■■■□□ 2.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 BCAMP50895 628 aa28.39■■■□□ 2.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPSM2P81274 684 aa28.39■■■□□ 2.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.39■■■□□ 2.14
RARA-AS1-201ENST00000581080 MCAMP43121 646 aa28.39■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.39■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.39■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNKSR1Q969H4 720 aa28.38■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.38■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLIM4O00461 696 aa28.37■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FSD1Q9BTV5 496 aa28.37■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 GYG1P46976 350 aa28.37■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.37■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNRKQ9NRH2 765 aa28.37■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.36■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP2B4P23634 1241 aa28.36■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLRK1P26718 216 aa28.36■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.36■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.35■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZAP70P43403 619 aa28.35■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 PI16Q6UXB8 463 aa28.35■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.35■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 VPS37DQ86XT2 251 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 GGA1Q9UJY5 639 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 HIP1O00291 1037 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 RASGRF1Q13972 1273 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 TICAM2Q86XR7 235 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.34■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.33■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPATA5Q8NB90 893 aa28.33■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.33■■■□□ 2.13
RARA-AS1-201ENST00000581080 UFL1O94874 794 aa28.32■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.32■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.32■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLLQ9UGP5 575 aa28.32■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 LTBP1Q14766 1721 aa28.31■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTGER2P43116 358 aa28.31■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 TGFB2P61812 414 aa28.31■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 OLFM4Q6UX06 510 aa28.31■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLX4Q8IY92 1834 aa28.31■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 DPEP1P16444 411 aa28.3■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNA3P22001 575 aa28.3■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 MPNDQ8N594 471 aa28.3■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.3■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 CACNA1SQ13698 1873 aa28.3■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0G2JLW4 131 aa28.29■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.29■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 REC8O95072 547 aa28.29■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.29■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEMA3EO15041 775 aa28.28■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBTB22O15209 634 aa28.28■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTLL6Q8N841 843 aa28.28■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL25Q9H293 177 aa28.28■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 C6orf229H3BNL8 230 aa28.27■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 SGSM2O43147 1006 aa28.27■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM227BQ96M60 508 aa28.27■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.27■■■□□ 2.12
RARA-AS1-201ENST00000581080 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 MED23Q9ULK4 1368 aa28.25■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.25■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.25■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.25■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.25■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.24■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.24■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0D9SFI3 127 aa28.24■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP26Q9BXU7 913 aa28.24■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHGBP05060 677 aa28.23■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAD50Q92878 1312 aa28.23■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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