RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580127.5

MKS1-209, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5

Gene MKS1, Length 843 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-209ENST00000580127 IGKV5-2P06315 115 aa22.9■■□□□ 1.26
MKS1-209ENST00000580127 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MKS1-209ENST00000580127 CCDC27Q2M243 656 aa22.9■■□□□ 1.26
MKS1-209ENST00000580127 CSRNP1Q96S65 589 aa22.9■■□□□ 1.26
MKS1-209ENST00000580127 MED23Q9ULK4 1368 aa22.89■■□□□ 1.26
MKS1-209ENST00000580127 H7C1W4 665 aa22.89■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.89■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 FBXW7Q969H0 707 aa22.89■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.89■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.89■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 GREM2Q9H772 168 aa22.89■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 COL4A1P02462 1669 aa22.89■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.88■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.88■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 MYH3P11055 1940 aa22.87■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.87■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 PSME4Q14997 1843 aa22.87■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 KCNJ4P48050 445 aa22.86■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.86■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 WWC1Q8IX03 1113 aa22.86■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 IL16Q14005 1332 aa22.85■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 DACT2Q5SW24 774 aa22.85■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.84■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 GCKRQ14397 625 aa22.84■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.84■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 ITGA6P23229 1130 aa22.83■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.83■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.83■■□□□ 1.25
MKS1-209ENST00000580127 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.82■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 FLIIQ13045 1269 aa22.82■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.82■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 LINS1Q8NG48 757 aa22.82■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.81■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 WNT10BO00744 389 aa22.81■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 G2E3Q7L622 706 aa22.81■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.81■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 CACNA1FO60840 1977 aa22.81■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.81■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 CSF1RP07333 972 aa22.8■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 GTF2IP78347 998 aa22.78■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 SREBF2Q12772 1141 aa22.78■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.78■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 MXD3Q9BW11 206 aa22.78■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 TM4SF4P48230 202 aa22.77■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 DLGAP5Q15398 846 aa22.77■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.77■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.77■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 WDR63Q8IWG1 891 aa22.77■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 SPEF2Q9C093 1822 aa22.77■■□□□ 1.24
MKS1-209ENST00000580127 MYO1BO43795 1136 aa22.76■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 CHRNDQ07001 517 aa22.76■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 MOB2Q70IA6 237 aa22.76■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.75■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 CD209Q9NNX6 404 aa22.75■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.75■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 SASH1O94885 1247 aa22.74■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 INHBEP58166 350 aa22.74■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 VAMP4O75379 141 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 TBC1D8O95759 1140 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 ALDH1A1P00352 501 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 CASP7P55210 303 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 MRS2Q9HD23 443 aa22.73■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.72■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.72■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 PRKG1Q13976 671 aa22.71■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 CCDC184Q52MB2 194 aa22.71■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.71■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.71■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.71■■□□□ 1.23
MKS1-209ENST00000580127 UNCXA6NJT0 531 aa22.7■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 TAF5LO75529 589 aa22.7■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.7■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 GPR25O00155 361 aa22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 ANP32CO43423 234 aa22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 SLC34A2O95436 690 aa22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 KLRK1P26718 216 aa22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 SOX10P56693 466 aa22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms