RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD1Q15327 319 aa28.5■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERFEQ4G0M1 354 aa28.5■■■□□ 2.15
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.5■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNPATO15228 680 aa28.49■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTMR6Q9Y217 621 aa28.49■■■□□ 2.15
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GJB2P29033 226 aa28.49■■■□□ 2.15
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