RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572936.5

MPDU1-211, Transcript of mannose-P-dolichol utilization defect 1, humanhuman

TSL 5

Gene MPDU1, Length 1,102 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPDU1-211ENST00000572936 USP48Q86UV5 1035 aa22.98■■□□□ 1.27
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MPDU1-211ENST00000572936 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.98■■□□□ 1.27
MPDU1-211ENST00000572936 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.98■■□□□ 1.27
MPDU1-211ENST00000572936 PSME4Q14997 1843 aa22.97■■□□□ 1.27
MPDU1-211ENST00000572936 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
MPDU1-211ENST00000572936 ATP2B4P23634 1241 aa22.97■■□□□ 1.27
MPDU1-211ENST00000572936 MAP2K2P36507 400 aa22.97■■□□□ 1.27
MPDU1-211ENST00000572936 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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MPDU1-211ENST00000572936 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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MPDU1-211ENST00000572936 KIF16BQ96L93 1317 aa22.97■■□□□ 1.27
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MPDU1-211ENST00000572936 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.93■■□□□ 1.26
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MPDU1-211ENST00000572936 MED23Q9ULK4 1368 aa22.92■■□□□ 1.26
MPDU1-211ENST00000572936 EGFRP00533 1210 aa22.92■■□□□ 1.26
MPDU1-211ENST00000572936 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.92■■□□□ 1.26
MPDU1-211ENST00000572936 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.92■■□□□ 1.26
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MPDU1-211ENST00000572936 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.91■■□□□ 1.26
MPDU1-211ENST00000572936 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.91■■□□□ 1.26
MPDU1-211ENST00000572936 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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MPDU1-211ENST00000572936 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.9■■□□□ 1.26
MPDU1-211ENST00000572936 PODNQ7Z5L7 613 aa22.9■■□□□ 1.26
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MPDU1-211ENST00000572936 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.88■■□□□ 1.25
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MPDU1-211ENST00000572936 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.86■■□□□ 1.25
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MPDU1-211ENST00000572936 RGMBQ6NW40 437 aa22.85■■□□□ 1.25
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MPDU1-211ENST00000572936 ZNF609O15014 1411 aa22.84■■□□□ 1.25
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MPDU1-211ENST00000572936 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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MPDU1-211ENST00000572936 SNAP23O00161 211 aa22.8■■□□□ 1.24
MPDU1-211ENST00000572936 PLIN1O60240 522 aa22.8■■□□□ 1.24
MPDU1-211ENST00000572936 MEIS3Q99687 375 aa22.8■■□□□ 1.24
MPDU1-211ENST00000572936 TNNQ9UQP3 1299 aa22.8■■□□□ 1.24
MPDU1-211ENST00000572936 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.8■■□□□ 1.24
MPDU1-211ENST00000572936 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.8■■□□□ 1.24
MPDU1-211ENST00000572936 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.79■■□□□ 1.24
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