RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 USP17L3A6NCW0 530 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 USP17L4A6NCW7 530 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 ATP2B4P23634 1241 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 KLRK1P26718 216 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 SOX10P56693 466 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 DACT2Q5SW24 774 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 G2E3Q7L622 706 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 USP17L1Q7RTZ2 530 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 PODNQ7Z5L7 613 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa17.61■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 KSR2Q6VAB6 950 aa17.6■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 UBE2Q2LH0YL09 131 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC30Q5VVM6 783 aa17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 NEURL1BA8MQ27 555 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 DDX58O95786 925 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 CCT4P50991 539 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 FKBP1BP68106 108 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC184Q52MB2 194 aa17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 CCER2I3L3R5 266 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 WNT10BO00744 389 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 SASH1O94885 1247 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GUL6 1792 aa17.57■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 H7C1W4 665 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 CASP7P55210 303 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa17.55■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 TBC1D8O95759 1140 aa17.55■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 FBXW7Q969H0 707 aa17.55■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 IRS2Q9Y4H2 1338 aa17.54■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 SNAP23O00161 211 aa17.54■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 STRIP1Q5VSL9 837 aa17.54■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.54■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 FZD1Q9UP38 647 aa17.54■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 COA1Q9GZY4 146 aa17.53■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.53■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.53■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF804BA4D1E1 1349 aa17.52■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 ITGA6P23229 1130 aa17.52■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 GCKRQ14397 625 aa17.52■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 KIAA0825Q8IV33 1275 aa17.52■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 PLA2G12BQ9BX93 195 aa17.52■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa17.52■□□□□ 0.4
SPNS3-202ENST00000572078 MYO3BQ8WXR4 1341 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 SLC4A2P04920 1241 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 CSF1RP07333 972 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 TM4SF4P48230 202 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 NEXNQ0ZGT2 675 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 PRKG1Q13976 671 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 WWC1Q8IX03 1113 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 CERS5Q8N5B7 392 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 STK31Q9BXU1 1019 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 LEMD3Q9Y2U8 911 aa17.51■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 AOX1Q06278 1338 aa17.5■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 GTF2IP78347 998 aa17.5■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 TTLL5Q6EMB2 1281 aa17.5■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 OGFOD1Q8N543 542 aa17.5■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 CHRNDQ07001 517 aa17.49■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 FLIIQ13045 1269 aa17.49■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC27Q2M243 656 aa17.49■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 ECM29Q5VYK3 1845 aa17.49■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 LAMB1P07942 1786 aa17.48■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 GPR25O00155 361 aa17.48■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 LDLRAD1Q5T700 205 aa17.48■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 CD209Q9NNX6 404 aa17.48■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 HTTP42858 3142 aa17.48■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 TAF5LO75529 589 aa17.47■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.47■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 ANKRD2Q9GZV1 360 aa17.47■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 FANCIQ9NVI1 1328 aa17.47■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 FOXO4P98177 505 aa17.46■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 SPRYD7Q5W111 196 aa17.46■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 DNAAF4Q8WXU2 420 aa17.46■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 MPHOSPH8Q99549 860 aa17.46■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.46■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SPNS3-202ENST00000572078 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 NF2P35240 595 aa17.45■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 EPHA10Q5JZY3 1008 aa17.45■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 LINS1Q8NG48 757 aa17.45■□□□□ 0.38
SPNS3-202ENST00000572078 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms