RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 JMYQ8N9B5 988 aa22.39■■□□□ 1.17
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CTDNEP1-207ENST00000572043 USP44Q9H0E7 712 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 CEP350Q5VT06 3117 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.37■■□□□ 1.17
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.37■■□□□ 1.17
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CTDNEP1-207ENST00000572043 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.36■■□□□ 1.17
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CTDNEP1-207ENST00000572043 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.36■■□□□ 1.17
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CTDNEP1-207ENST00000572043 USP48Q86UV5 1035 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNTNAP1P78357 1384 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L8P0C7I0 530 aa22.34■■□□□ 1.17
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CTDNEP1-207ENST00000572043 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 CD209Q9NNX6 404 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 SCN9AQ15858 1988 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.33■■□□□ 1.17
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CTDNEP1-207ENST00000572043 BCAR3O75815 825 aa22.32■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC24Q50LG9 513 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-207ENST00000572043 GGA3Q9NZ52 723 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF16BQ96L93 1317 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRM1Q13255 1194 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 JAG2Q9Y219 1238 aa22.31■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-207ENST00000572043 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-207ENST00000572043 METTL24Q5JXM2 366 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.3■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF609O15014 1411 aa22.29■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-207ENST00000572043 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.28■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.27■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-207ENST00000572043 WNT10BO00744 389 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 VPS37DQ86XT2 251 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDCA5Q96FF9 252 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1B0GUL6 1792 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 EYA2O00167 538 aa22.21■■□□□ 1.15
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