RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562136.1

HERC2-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 2

Gene HERC2, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-202ENST00000562136 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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HERC2-202ENST00000562136 C2orf69Q8N8R5 385 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC2-202ENST00000562136 LINS1Q8NG48 757 aa16.06■□□□□ 0.16
HERC2-202ENST00000562136 CCDC102AQ96A19 550 aa16.06■□□□□ 0.16
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HERC2-202ENST00000562136 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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HERC2-202ENST00000562136 ALDH1L1O75891 902 aa15.94■□□□□ 0.14
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HERC2-202ENST00000562136 SASH1O94885 1247 aa15.92■□□□□ 0.14
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HERC2-202ENST00000562136 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-202ENST00000562136 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-202ENST00000562136 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-202ENST00000562136 KAZALD1Q96I82 304 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-202ENST00000562136 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HERC2-202ENST00000562136 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC2-202ENST00000562136 KCNJ4P48050 445 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC2-202ENST00000562136 MAP3K11Q16584 847 aa15.91■□□□□ 0.14
HERC2-202ENST00000562136 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
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