RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	SIAH2	O43255	324 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	SSFA2	P28290	1259 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	GCGR	P47871	477 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	PDE3A	Q14432	1141 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	USP16	Q9Y5T5	823 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	SCN7A	Q01118	1682 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		7.31	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ATP10D	Q9P241	1426 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	NUP98	P52948	1817 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	RPS6KA4	O75676	772 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	FLII	Q13045	1269 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	KRT24	Q2M2I5	525 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	COL15A1	P39059	1388 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	C4A	P0C0L4	1744 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	GPR37	O15354	613 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ITPK1	Q13572	414 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	AK7	Q96M32	723 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965		Q3C1V9	767 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	NBPF14	Q5TI25	921 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	KSR2	Q6VAB6	950 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	ABCC4	O15439	1325 aa		7.27	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		7.27	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	BCAR3	O75815	825 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	A1BG	P04217	495 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM27	P14373	513 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	SULF1	Q8IWU6	871 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	STK32B	Q9NY57	414 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NARF	Q9UHQ1	456 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	ALDH1L1	O75891	902 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	MYL6B	P14649	208 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	RFC4	P35249	363 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	SCARF1	Q14162	830 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	SLC15A2	Q16348	729 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	COPS6	Q7L5N1	327 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHP1-208	ENST00000560965	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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