RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GUL6 1792 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPA4P34932 840 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC102BQ68D86 513 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC125Q86Z20 511 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 MMP10P09238 476 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE4AQ14139 1066 aa21.48■■□□□ 1.03
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZAP70P43403 619 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHKA1P46020 1223 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCAMP43121 646 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANAPC15P60006 121 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PI16Q6UXB8 463 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 MED23Q9ULK4 1368 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSL1Q68DK7 614 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST18O60284 1047 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNJ4P48050 445 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEK4P51957 841 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASEFQ8IZ41 740 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP4K1Q92918 833 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL17RAQ96F46 866 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 BBOX1O75936 387 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCAMP50895 628 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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USP3-AS1-208ENST00000560962 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE6BP35913 854 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASGRF1Q13972 1273 aa21.4■■□□□ 1.02
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA5Q8NB90 893 aa21.4■■□□□ 1.02
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SRGNP10124 158 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.39■■□□□ 1.01
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USP3-AS1-208ENST00000560962 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPR1P16066 1061 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMC4Q7Z404 712 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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USP3-AS1-208ENST00000560962 XDHP47989 1333 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.37■■□□□ 1.01
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USP3-AS1-208ENST00000560962 GYG1P46976 350 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNB2Q92953 911 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAST3O60307 1309 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC27A2O14975 620 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB22O15209 634 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 WASHC4Q2M389 1173 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OSBP2Q969R2 916 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0R2C6 588 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH7P12883 1935 aa21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLRK1P26718 216 aa21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEMA3EO15041 775 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBR1Q14596 966 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS53Q5VIR6 699 aa21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC51AQ86UW1 340 aa21.34■■□□□ 1.01
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