RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560650.1

CPEB1-AS1-201, CPEB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1-AS1, Length 2,138 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 OSBP2Q969R2 916 aa25.1■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LARGE1O95461 756 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 M0R2C6 588 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC5A1P13866 664 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ANKRD1Q15327 319 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.09■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PHKA1P46020 1223 aa25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 WASHC4Q2M389 1173 aa25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NEK1Q96PY6 1258 aa25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZPR1O75312 459 aa25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MCTP1Q6DN14 999 aa25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.07■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ME3Q16798 604 aa25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 APPBP2Q92624 585 aa25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SCN7AQ01118 1682 aa25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.06■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.05■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SETDB2Q96T68 719 aa25.05■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SBF2Q86WG5 1849 aa25.05■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SNAP23O00161 211 aa25.04■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NYXQ9GZU5 481 aa25.04■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LY75O60449 1722 aa25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CHRNDQ07001 517 aa25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.02■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ADD2P35612 726 aa25.01■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.01■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.01■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 MYH7P12883 1935 aa25.01■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ST3GAL1Q11201 340 aa25.01■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.01■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NECAB1Q8N987 351 aa25.01■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SPATA5Q8NB90 893 aa25■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CTNNA3Q9UI47 895 aa25■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 GJB2P29033 226 aa24.99■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 UBE3CQ15386 1083 aa24.99■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 GPAA1O43292 621 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RASGRF1Q13972 1273 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 Q6ZUG5 572 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 A0A0G2JLW4 131 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 E7EWF7 191 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FOXP2O15409 715 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 SYT1P21579 422 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 RFC4P35249 363 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 COL4A1P02462 1669 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 STX6O43752 255 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 BCAMP50895 628 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 NLRP3Q96P20 1036 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PHF14O94880 888 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.97■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 C4BP0C0L5 1744 aa24.96■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 FGAP02671 866 aa24.96■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 PDE6AP16499 860 aa24.95■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.95■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.95■■□□□ 1.59
CPEB1-AS1-201ENST00000560650 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms