RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNTROBQ8N137 903 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MEIS3Q99687 375 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.49■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 FBXW7Q969H0 707 aa15.49■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNNQ9UQP3 1299 aa15.49■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SHTN1A0MZ66 631 aa15.48■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBE4AQ14139 1066 aa15.48■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRRC24Q50LG9 513 aa15.48■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 METTL24Q5JXM2 366 aa15.48■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.48■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.48■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 CD209Q9NNX6 404 aa15.48■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 HTRA3P83110 453 aa15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 EYA2O00167 538 aa15.46■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP17L8P0C7I0 530 aa15.46■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 PASKQ96RG2 1323 aa15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDE8BO95263 885 aa15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNAI2P04899 355 aa15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GTF2IP78347 998 aa15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 DACT2Q5SW24 774 aa15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GMLQ99445 158 aa15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.45■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL1R1P14778 569 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 VPS37DQ86XT2 251 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 OGFOD1Q8N543 542 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MXD3Q9BW11 206 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SIL1Q9H173 461 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CREBZFQ9NS37 354 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FBXO3Q9UK99 471 aa15.44■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPEF2Q9C093 1822 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SRGAP3O43295 1099 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CIAO1O76071 339 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GYG1P46976 350 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF609O15014 1411 aa15.43■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 EGFRP00533 1210 aa15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MS4A1P11836 297 aa15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MMP14P50281 582 aa15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.42■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAF5O00463 557 aa15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SASH1O94885 1247 aa15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RLBP1P12271 317 aa15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MTX1Q13505 466 aa15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLRG1Q96E93 195 aa15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 COPRSQ9NQ92 184 aa15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC5A1P13866 664 aa15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCARF1Q14162 830 aa15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP48Q86UV5 1035 aa15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 LPIN2Q92539 896 aa15.4■□□□□ 0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCN9AQ15858 1988 aa15.39■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 FGFR2P21802 821 aa15.39■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PANK1Q8TE04 598 aa15.39■□□□□ 0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 GGA3Q9NZ52 723 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms