RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559365.5

PSMA4-212, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-212ENST00000559365 KRT26Q7Z3Y9 468 aa34.27■■■■□ 3.08
PSMA4-212ENST00000559365 TNS4Q8IZW8 715 aa34.27■■■■□ 3.08
PSMA4-212ENST00000559365 AIDAQ96BJ3 306 aa34.27■■■■□ 3.08
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF804BA4D1E1 1349 aa34.27■■■■□ 3.08
PSMA4-212ENST00000559365 ALDH1L1O75891 902 aa34.26■■■■□ 3.08
PSMA4-212ENST00000559365 KLRK1P26718 216 aa34.26■■■■□ 3.08
PSMA4-212ENST00000559365 CHRNDQ07001 517 aa34.26■■■■□ 3.08
PSMA4-212ENST00000559365 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
PSMA4-212ENST00000559365 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 E9PSI1 815 aa34.25■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa34.25■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 COA1Q9GZY4 146 aa34.25■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 CHMP3Q9Y3E7 222 aa34.25■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 ADM5C9JUS6 153 aa34.24■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 LMBR1LQ6UX01 489 aa34.24■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 GGA3Q9NZ52 723 aa34.24■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 USP17L8P0C7I0 530 aa34.23■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 DACT2Q5SW24 774 aa34.23■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 HHIPL1Q96JK4 782 aa34.22■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 MXD3Q9BW11 206 aa34.22■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 SLFN5Q08AF3 891 aa34.21■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 MYOZ2Q9NPC6 264 aa34.21■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 SNAP23O00161 211 aa34.2■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 SCARF1Q14162 830 aa34.2■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 FBXW7Q969H0 707 aa34.2■■■■□ 3.07
PSMA4-212ENST00000559365 AOC2O75106 756 aa34.19■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 TAF5LO75529 589 aa34.19■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 KCNJ4P48050 445 aa34.19■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 STRIP1Q5VSL9 837 aa34.19■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 PRDM10Q9NQV6 1147 aa34.19■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 IRS2Q9Y4H2 1338 aa34.18■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC57Q2TAC2 916 aa34.17■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 SULF1Q8IWU6 871 aa34.17■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 SSH1Q8WYL5 1049 aa34.17■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.17■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 MYO3BQ8WXR4 1341 aa34.16■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 KAZALD1Q96I82 304 aa34.16■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 SUCLG2Q96I99 432 aa34.16■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 MAP2K2P36507 400 aa34.15■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 LBX1P52954 281 aa34.15■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 HUNKP57058 714 aa34.15■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 UTYO14607 1347 aa34.14■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 PTPRCP08575 1304 aa34.14■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 TTLL5Q6EMB2 1281 aa34.14■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PSMA4-212ENST00000559365 TAF7LQ5H9L4 462 aa34.13■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa34.13■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 CDCA5Q96FF9 252 aa34.13■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 CD209Q9NNX6 404 aa34.13■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 CCER2I3L3R5 266 aa34.12■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 GTF2IP78347 998 aa34.12■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa34.11■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 NBPF9Q3BBW0 867 aa34.11■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 C2orf69Q8N8R5 385 aa34.11■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 CNNM1Q9NRU3 951 aa34.11■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 OGFOD1Q8N543 542 aa34.1■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 BEGAINQ9BUH8 593 aa34.09■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 PLIN1O60240 522 aa34.08■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
PSMA4-212ENST00000559365 WNT10BO00744 389 aa34.07■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 CAPN15O75808 1086 aa34.07■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 ALDH1L2Q3SY69 923 aa34.07■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 RGMBQ6NW40 437 aa34.07■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 KIAA0825Q8IV33 1275 aa34.07■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 ZIC5Q96T25 663 aa34.06■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 MMP14P50281 582 aa34.05■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 NOGQ13253 232 aa34.05■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF804AQ7Z570 1209 aa34.05■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa34.05■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 ECM29Q5VYK3 1845 aa34.04■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 SASH1O94885 1247 aa34.04■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 IL1R1P14778 569 aa34.04■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 CERS5Q8N5B7 392 aa34.04■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 ANKRD44Q8N8A2 993 aa34.04■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 SMC4Q9NTJ3 1288 aa34.03■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 TSKSQ9UJT2 592 aa34.02■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 HDAC9Q9UKV0 1011 aa34.02■■■■□ 3.04
PSMA4-212ENST00000559365 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
PSMA4-212ENST00000559365 USP44Q9H0E7 712 aa34.01■■■■□ 3.03
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
PSMA4-212ENST00000559365 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa34■■■■□ 3.03
PSMA4-212ENST00000559365 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa34■■■■□ 3.03
PSMA4-212ENST00000559365 UBE4AQ14139 1066 aa33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms