RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.04■■□□□ 1.28
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TSPAN3-204ENST00000558394 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TSPAN3-204ENST00000558394 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TSPAN3-204ENST00000558394 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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TSPAN3-204ENST00000558394 SASH1O94885 1247 aa23.01■■□□□ 1.27
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TSPAN3-204ENST00000558394 ERO1AQ96HE7 468 aa22.95■■□□□ 1.26
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TSPAN3-204ENST00000558394 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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TSPAN3-204ENST00000558394 CRHR2Q13324 411 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ARHGEF6Q15052 776 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPAN3-204ENST00000558394 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPAN3-204ENST00000558394 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPAN3-204ENST00000558394 STK31Q9BXU1 1019 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPAN3-204ENST00000558394 VEZTQ9HBM0 779 aa22.85■■□□□ 1.25
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