RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CHRNA5P30532 468 aa11.4□□□□□ -0.58
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CS-220ENST00000550700 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
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CS-220ENST00000550700 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.4□□□□□ -0.58
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CS-220ENST00000550700 STAP2Q9UGK3 403 aa11.4□□□□□ -0.58
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CS-220ENST00000550700 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-220ENST00000550700 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
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CS-220ENST00000550700 BCS1LQ9Y276 419 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-220ENST00000550700 HIP1O00291 1037 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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CS-220ENST00000550700 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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CS-220ENST00000550700 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 AKAP11Q9UKA4 1901 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 SNED1Q8TER0 1413 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.31□□□□□ -0.6
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