RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 EIF6P56537 245 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 CLEC4GQ6UXB4 293 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 LRP10Q7Z4F1 713 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 ZNF652Q9Y2D9 606 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 IL16Q14005 1332 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 ERVV-1B6SEH8 477 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 HOXB7P09629 217 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 SCNN1DP51172 638 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 GPTP24298 496 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 CIAPIN1Q6FI81 312 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 SNED1Q8TER0 1413 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 CELF2O95319 508 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ZNF428Q96B54 188 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 PSMD1Q99460 953 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ZNF408Q9H9D4 720 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 HYPKQ9NX55 129 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ALDH1B1P30837 517 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 TPTE2Q6XPS3 522 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ZNF34Q8IZ26 560 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 OXER1Q8TDS5 423 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ZNF521Q96K83 1311 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 VAMP4O75379 141 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 SUSD4Q5VX71 490 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ZIC5Q96T25 663 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 UBN2Q6ZU65 1347 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 TCIRG1Q13488 830 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 SLC51AQ86UW1 340 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 STK31Q9BXU1 1019 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 FOSBP53539 338 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 NOGQ13253 232 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 G2E3Q7L622 706 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 NIM1KQ8IY84 436 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 GPRC5DQ9NZD1 345 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-217ENST00000550044 ABCC12Q96J65 1359 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 SLFN5Q08AF3 891 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 NYXQ9GZU5 481 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 NUP98P52948 1817 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 E9PSI1 815 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 LAPTM4AQ15012 233 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 PARP10Q53GL7 1025 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 NLRP10Q86W26 655 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 PPIP5K2O43314 1243 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 NTSR2O95665 410 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 HUNKP57058 714 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 CRY2Q49AN0 593 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 MYD88Q99836 296 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 AKAP11Q9UKA4 1901 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 PI4KAP2A4QPH2 592 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 AOC3Q16853 763 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 TRPA1O75762 1119 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 CXCL9Q07325 125 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 KSR2Q6VAB6 950 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 TRPM4Q8TD43 1214 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-217ENST00000550044 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
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